鉴定癌症的表观遗传学变化

癌症表观遗传学的研究方法有助于了解致癌通路和癌症进展

癌症表观遗传学

癌症表观遗传学变化的研究(如异常甲基化和转录因子结合改变)可以提供对重要致癌通路的了解。甲基化变化常常会使基因激活或沉默,表观基因组的变化可以影响基因表达和癌症进展的速度。

新一代测序(NGS)和芯片技术可以检测到甲基化模式和癌症中其他表观遗传学的变化。Illumina与癌症表观遗传学专家进行了合作,确保其NGS和芯片解决方案能满足该领域快速变化的需求。

癌症表观遗传学插画

异常甲基化是癌症中常见的表观遗传学变化。NGS可以帮助研究人员鉴定和比较癌症细胞和正常细胞的甲基化,在单核苷酸水平上了解甲基化模式。

深入了解甲基化测序
追踪肿瘤进展

Christopher Mason博士介绍了如何通过转录组、表观基因组和表观转录组测序来追踪肿瘤进展。

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甲基化芯片能进行全表观基因组关联研究,可以同时分析多个癌症样本。芯片可以定量分析整个基因组的甲基化位点,帮助研究人员了解癌症相关基因和通路的调控。

深入了解甲基化芯片
研究表明甲基化水平在乳腺癌确诊前数年就已下降

一项对诊断前血液样本的研究鉴定了可以预测乳腺癌风险的全表观基因组低甲基化变化。

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特色癌症表观遗传学研究

 
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转录因子结合的改变是另一个与癌症相关的常见表观遗传学变化。染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)能提供癌症细胞和正常细胞在整个基因组内与DNA相关的蛋白活性的信息。

这种方法能让研究人员以一种无假设的方法来研究基因表达调控。深度测序能检测通常在转录因子中观察到的低丰度蛋白质-DNA相互作用。

深入了解ChIP-Seq
对癌症表观基因组进行测序

在第49集Illumina基因组学播客中,Susan Clark博士介绍了表观遗传学在癌症和人类生物学领域的作用。

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利用NGS研究染色质

一种绘制开放染色质区域图谱的方法,可以帮助研究人员更好地了解表观基因组及其对癌症和自身免疫性疾病的影响。

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