鉴定癌症的表观遗传学变化

癌症表观遗传学的研究方法有助于了解致癌通路和癌症进展

癌症表观遗传学

癌症表观遗传学变化的研究(如异常甲基化和转录因子结合改变)可以提供对重要致癌通路的了解。甲基化变化常常会使基因激活或沉默,表观基因组的变化可以影响基因表达和癌症进展的速度。

新一代测序(NGS)和芯片技术可以检测到甲基化模式和癌症中其他表观遗传学的变化。Illumina与癌症表观遗传学专家进行了合作,确保其NGS和芯片解决方案能满足该领域快速变化的需求。

癌症表观遗传学插画

异常甲基化是癌症中常见的表观遗传学变化。NGS可以帮助研究人员鉴定和比较癌症细胞和正常细胞的甲基化,在单核苷酸水平上了解甲基化模式。

深入了解甲基化测序
追踪肿瘤进展

Christopher Mason博士介绍了如何通过转录组、表观基因组和表观转录组测序来追踪肿瘤进展。

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甲基化芯片能进行全表观基因组关联研究,可以同时分析多个癌症样本。芯片可以定量分析整个基因组的甲基化位点,帮助研究人员了解癌症相关基因和通路的调控。

深入了解甲基化芯片
研究表明甲基化水平在乳腺癌确诊前数年就已下降

一项对诊断前血液样本的研究鉴定了可以预测乳腺癌风险的全表观基因组低甲基化变化。

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特色癌症表观遗传学研究

 
胶质瘤样本
用于脑肿瘤研究的NGS和甲基化芯片

Se Hoon Kim(医学博士)介绍了NGS panel和甲基化芯片如何共同为临床研究中的肿瘤鉴定提供支持。

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癌症转移之谜相关文章
甲基化和转移

研究人员使用甲基化芯片和NGS来研究癌症发展和转移的表观遗传学。

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烟叶
口腔癌的遗传基础

研究人员鉴定了与致死性口腔癌相关的基因组改变,包括体细胞和生殖系变异,以及启动子甲基化和转录的变化。

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转录因子结合的改变是另一个与癌症相关的常见表观遗传学变化。染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)能提供癌症细胞和正常细胞在整个基因组内与DNA相关的蛋白活性的信息。

这种方法能让研究人员以一种无假设的方法来研究基因表达调控。深度测序能检测通常在转录因子中观察到的低丰度蛋白质-DNA相互作用。

深入了解ChIP-Seq
对癌症表观基因组进行测序

在第49集Illumina基因组学播客中,Susan Clark博士介绍了表观遗传学在癌症和人类生物学领域的作用。

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The assay for transposase-accessible chromatin with sequencing (ATAC-Seq) involves sequencing regions of open chromatin across the genome. This information can provide insights into how chromatin packaging affects cancer gene expression.This method does not require prior knowledge of regulatory elements, making it a powerful epigenetic discovery tool.

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Cancer Epigenomics and a Cacophony of Gene Expression

In episode 21 of the Illumina Genomics Podcast, we discuss the epigenetics and epigenomics of cancer with Dr. Peter Scacheri, Professor of Genetics and Genome Sciences at Case Western Reserve University in Cleveland, Ohio.

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卡罗来纳乳腺癌研究中乳腺癌启动子甲基化的种族变异

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髓母细胞瘤亚群在原发部位和转移部位保持了稳定

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前列腺癌的表观遗传学生物标记:新一代技术

这篇综述介绍了最近的前列腺癌表观遗传学领域的发现,重点介绍了其作为诊断、细分和监测的生物标记的潜力。

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甲基化检测方法领域指南

这篇基于芯片和测序的甲基化检测方法综述提供了有用的癌症表观遗传学研究资源。

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甲基化研究人员
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