新一代测序用于传染病监控
新一代测序（NGS）提供了一种通用的无假设方法，可用于病毒、细菌或寄生虫。NGS的基因组分析带来了高分辨率的信息，可区分差别仅为一个SNP的病原体菌株，从而取代多项检测。
Illumina的NGS技术带来了快速的结果和高质量的数据，传染病专家可以此作为现代化的工具，来鉴定、追踪和应对疾病爆发。
全基因组测序传染病监控的主要方法是。
传染病监控
基因组学正在扩大我们对病原体进化、宿主-病原体相互作用以及抗生素耐药性的了解。基因组学也在改变现代传染病的监控，以及公共卫生专家用来防止各大疾病（如结核病、HIV和流感）流行和大流行的方法。
目前评估传染源的方法包括基于抗体的检测、实时定量PCR、脉冲场凝胶电泳（PFGE）以及多位点序列分型（MLST）。这些方法通常只适用于少数有限的生物，且数据分析很主观。
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更多资源
文献
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