传染性疾病监测中的基因组学
基因组学正在改变现代传染性疾病的监测，帮助我们进一步了解病原体的进化，宿主-病原体的相互作用和抗生素耐药性。反过来，公共卫生专业人员正在改变他们用于研究，监测和预防时疫和流行病的方法，这些时疫和流行病包括诸如流感，结核，埃博拉，以及最近流行的冠状病毒。
评估传染性病原体的传统方法包括基于抗体的检测、实时PCR、脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）。这些方法通常仅对少量和确定数量的生物有用，并且数据分析可能是主观的。
NGS以及抗击冠状病毒
我们对新型冠状病毒COVID-19疫情的看法
严重的急性呼吸系统综合症冠状病毒COVID-19爆发是一个重要的提醒，国际社会必须加强国家和国际计划，以及早发现和应对未来的疾病暴发。
Illumina的技术已被用作鉴定冠状病毒一线检测的一部分。我们已在全球范围内提供我们的技术，以此来支持改善检测的应用和策略，并加强我们对COVID-19的流行病学、进化和毒力的追踪。
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Powering Metagenomic Detection of Respiratory Pathogens and Antimicrobial Resistance
This pandemic has underscored the need for new tools to detect, diagnose, and monitor emerging pathogens like SARS-CoV-2. Together with the Illumina respiratory virus oligo probe (RVOP) enrichment panel, this customized Explify RVOP application from IDbyDNA provides a sample-to-result solution for clinical metagenomics.
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Powerful, Easy to Perform Analysis with the IDbyDNA Explify Platform
The Explify Platform is a fully supported NGS-based, clinical metagenomics technology suite for clinical laboratories. Watch this video for a virtual tour to better understand how the Explify Platform streamlines processes, supports labs, improves results, and much, much more.
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NGS在传染性疾病监测中的优势
新一代测序（NGS）为传染性疾病的监测提供了一种通用的、无假设的方法，可以用于病毒、细菌或寄生虫的监测。使用NGS进行基因组分析可以提供高分辨率的信息，能区分仅相差一个单核苷酸多态性（SNP）的病原体菌株，并且无需进行多个检测。
Illumina NGS技术可快速获得结果，并提供高质量的数据来帮助公共卫生专业人员鉴定、追踪和应对传染性疾病的爆发。
特色传染性疾病产品
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更多资源
IDbyDNA Explify and NGS Identify UTI Pathogens
Accurate identification of uropathogens limits the development of UTIs and spread of antimicrobial resistance.
参考文献
- Lipkin WI (2013) The changing face of pathogen discovery and surveillance. Nat Rev Micobiol 11:133–141.
- Feero WG, Guttmacher AE. (2013) Microbial genomics and infectious diseases. N Engl J Med 365:347–357.
- Bao C-J, Cui L-B, Zhou M-H, Long L, Gao GF (2013) Live-animal markets and Influenza A (H7N9) virus infection. N Engl J Med 10.1056/NEJMc1306100.
- Lienau EK, Strain E, Wang C, Xheng J, Ottesen AR, et al. (2011) Identification of a Salmonellosis outbreak by means of a molecular sequencing. N Engl J Med 364:10.