DRAGEN平台可以在25分钟之内以30倍的覆盖度在本地处理整个人类基因组的NGS数据，而传统的基于CPU的系统需要的时间超过15小时。其创造了基因组数据分析的两项世界速度记录。2,3
DRAGEN平台可以减少服务器集群的内部投资和云计算资源的利用。
在2018年举行的PrecisionFDA Hidden Treasures热身挑战赛中，DRAGEN平台从识别出所有50个变异的平台中脱颖而出，在全基因组变异检出的六项精确度测量中有五项获得了最高分。1
DRAGEN平台可分析全基因组、全外显子组、靶向panel、生殖系和体细胞数据集以及RNA测序实验的测序数据。
Frequent releases continuously expand and improve the DRAGEN Platform while accommodating new applications and addressing evolving industry standards.
DRAGEN平台使各种规模和学科的实验室能够利用其基因组数据挖掘更多的信息。DRAGEN平台使用高度可重新配置的现场可编程门阵列技术（FPGA），通过加速硬件来实施基因组分析算法，例如BCL转换、定位、比对、分选、重复标记和单倍型变异检出。DRAGEN平台的基本功能解决了基因组分析中的常见难题，例如计算时间长和数据量大。
DRAGEN平台可在不影响精确度的前提下，实现快速、灵活和经济高效。DRAGEN平台的可重编程特性使Illumina能够开发自定义算法，还允许进行改进以便适于未来的应用。
DRAGEN on BaseSpace Sequence Hub couples speed and accuracy of the DRAGEN Platform with the security, cost savings, and intuitive interface of BaseSpace Sequence Hub.
DRAGEN on-premise conducts secondary analysis in a fraction of the time compared with a traditional CPU-based system, while still maintaining high accuracy.
名称 |
描述 |
Availability |
|---|---|---|
| Illumina DRAGEN Germline Pipeline | DRAGEN Germline Pipeline提供端到端（BCL ➝ VCF）NGS分析（包括用于提高精确度的高级误差模型校准）以及通过Illumina Expansion Hunter进行的重复序列延长检测和基因分型。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN Somatic Pipeline | DRAGEN Somatic Pipeline包括仅肿瘤模式和肿瘤-正常模式，用于检测肿瘤样本中的体细胞变异。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| DRAGEN Reference Builder | 此应用程序接受FASTA文件，并且可构建DRAGEN应用程序使用的专有参考。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN RNA Pipeline | The DRAGEN RNA Pipeline performs transcriptome analysis starting with splice junction discovery and alignment, followed by rapid alignment and splice junction mapping, quantification, and fusion detection. | On-Premise Coming soon on BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN Joint Genotyping/Population Pipeline | DRAGEN Joint Genotyping/Population Pipeline可在不影响精确度的前提下，在多个基因组中联合检出变异并快速扩展到数千个样本。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN CNV Pipeline | DRAGEN CNV Pipeline可进行生殖系和体细胞外显子组和基因组的拷贝数变异（CNV）分析。在发出最终检出结果之前，可使用不同水平的过滤条件来减少假阳性。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN Methylation Pipeline | DRAGEN Methylation Pipeline提供多种操作模式，包括仅参考比对模式和注释辅助模式。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
| Illumina DRAGEN Map + Align Pipeline | DRAGEN Map + Align Pipeline能够超快速地定位和比对外显子组和基因组的DNA和RNA。 | On-Premise On BaseSpace Sequence Hub |
Broad研究所的Anthony Philippakis和Illumina的Susan Tousi是合作伙伴，他们就GATK与Illumina测序仪的整合以及DRAGEN平台的实施如何促进硬件加速和数据分析标准化进行了讨论。
观看视频Leveraging DRAGEN, GeneDx is now able to grow its operations while keeping costs low, turnaround times short, and accuracy high.
Read Article在2018年举行的PrecisionFDA Hidden Treasures热身挑战赛中，DRAGEN平台从识别出所有50个变异的平台中脱颖而出，在全基因组变异检出的六项精确度测量中有五项获得了最高分。2
阅读文章DRAGEN平台可用于生物科学领域的众多应用。
快速分析测序基因组；随着计算工具的不断改进，加速重分析。
在快速获得结果至关重要时，减少基因组分析所需的时间。
利用硬件加速算法保持领先的持续分析需求。
利用所提供的参考资料分析具有不同基因组复杂性的动植物。
以快速的周转时间和高精确度分析靶向外显子组数据，确保重现性和高质量的结果。
DRAGEN provides the flexibility to insert a variety of input files and produce a range of output documents. This flexibility enables users to customize their experience and use and produce their desired file format.
This diagram shows steps in the DRAGEN Germline Pipeline as an example. The actual steps vary for each pipeline.
Enrichment Analysis with BaseSpace Correlation Engine
Technical Note | PDF2 MB
DRAGEN Accuracy Application Note
Application Note | HTML
Benefits of whole-genome sequencing
Brochure | PDF< 1 MB
Basespace Sequencing Hub Apps Quick Guide
Brochure | PDF< 1 MB
DRAGEN Bio-IT Platform on BaseSpace Sequence Hub
Data Sheet | PDF1 MB
Data Sheet | PDF1 MB
DRAGEN Germline Pipeline Specification Sheet
Data Sheet | HTML
Data Sheet | HTML
BaseSpace Correlation Engine mines over 20,000 genomic studies to get data-driven answers for genes, experiments, drugs and phenotypes for your research.
