DRAGEN v3.9 released July 2021 | New features include:
DRAGEN Azure Lvl 4 1 year License
20060410
BaseSpace Sequence Hub上的Illumina DRAGEN Bio-IT平台和数据提交应用程序还支持SARS-CoV-2 Data Toolkit。了解更多。
Illumina Connected Analytics上的DRAGEN
BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN
本地服务器上的DRAGEN
DRAGEN平台可以在25分钟之内以30倍的覆盖度在本地处理整个人类基因组的NGS数据，而传统的基于CPU的系统需要的时间超过15小时。其创造了基因组数据分析的两项世界速度记录。2,3
在Illumina BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上运行时，对于30X测序深度的基因组分析，费用约为5美元/样本，对于100X测序深度的外显子组分析，费用约为3美元/样本。
In the 2020 PrecisionFDA Truth Challenge V2, DRAGEN won Difficult to Map Regions and All Benchmark Regions on Illumina Sequencing data.1
DRAGEN平台可分析全基因组、全外显子组、靶向panel、生殖系和体细胞数据集以及RNA测序实验的测序数据。
DRAGEN ORA（Original Read Archive）压缩技术针对FASTQ文件的高压缩比、快速压缩和解压缩，同时保持数据完整性进行了优化。
经常更新，不断扩展并改进DRAGEN平台，能适应新的应用并满足不断发展的行业标准。DRAGEN的更新可通过版本来管理，用户可以根据需要选择加入或退出新的更新。
Illumina DRAGEN团队非常高兴地宣布，他们在Illumina测序数据的难绘制区域和所有基准区域中展现了优于其他技术的性能。这标志着优化主要新功能的开始，包括结构变异、拷贝数变异和重复延长。我们的成功证明，我们现在能以更高的准确性检出难绘制区域中的变异。
了解更多
DRAGEN平台使各种规模和学科的实验室能够利用其基因组数据挖掘更多的信息。DRAGEN平台使用高度可重新配置的现场可编程门阵列技术（FPGA），通过加速硬件来实施基因组分析算法，例如BCL转换、定位、比对、分选、重复标记和单倍型变异检出。DRAGEN平台的基本功能解决了基因组分析中的常见难题，例如计算时间长和数据量大。
DRAGEN平台可在不影响精确度的前提下，实现快速、灵活和经济高效。DRAGEN平台的可重编程特性使Illumina能够开发自定义算法，还允许进行改进以便适于未来的应用。
| DRAGEN On-Premise Server | BaseSpace | Illumina Connected Analytics | NextSeq 1000/2000 | Multi-Cloud Bring Your Own License | |
|---|---|---|---|---|---|
| 样本拆分（BCL转换） | |||||
| DRAGEN ORA lossless genomic compression | |||||
| 定位和比对 | |||||
| 全基因组（生殖系和体细胞） | Germline only | ||||
| 外显子组富集（生殖系和体细胞） | |||||
| COVIDSeq | |||||
| RNA Pathogen Detection | |||||
| RNA-Seq （基因融合和定量） | |||||
| Single-Cell RNA | |||||
| Joint Genotyping | |||||
| Methylation | |||||
| TSO 500 Liquid | |||||
| Metagenomics |
Phosphorus的联合创始人兼首席执行官Alexander Bisignano介绍了该公司如何使用DRAGEN Bio-IT平台以可承受的价格在现场进行基因组数据分析。
阅读访谈录
BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN结合了DRAGEN平台的速度、准确性与BaseSpace Sequence Hub的安全性、经济和直观界面。
与传统的基于CPU的系统相比，本地DRAGEN可以在短时间内进行二级分析，同时保持高精确度。
机载DRAGEN Bio-IT平台可提供准确的超快速二级分析方案。
AWS和Azure上的DRAGEN使您可以在首选云端环境下访问虚拟镜像中的DRAGEN软件。
In this webinar, Eric Banks of the Broad Institute describes some of the issues encountered while investigating the differences between DRAGEN and GATK tools, highlighting the improvements to methods implemented in the new Best Practices pipeline.
You’ll also learn how the team assessed functional equivalency between the open source and licensed (hardware-accelerated) version of the pipeline, showing results between the two methods on the same source input.
View Webinar RecordingDRAGEN平台可用于生物科学领域的众多应用。
快速分析测序基因组；随着计算工具的不断改进，加速重分析。
在快速获得结果至关重要时，减少基因组分析所需的时间。
准确、快速地分析仅肿瘤和肿瘤/正常样本。
利用所提供的参考资料分析具有不同基因组复杂性的动植物。
以快速的周转时间和高精确度分析靶向外显子组数据，确保重现性和高质量的结果。
DRAGEN提供了一定的灵活性，可以插入各种输入文件和生成各种输出文件。这种灵活性使用户能够定制他们的体验，并使用和生成他们想要的文件格式。
该图以DRAGEN Germline流程中的步骤为例。各个流程的实际步骤有所不同。
Integrating the Illumina DRAGEN Bio-IT Platform within your Infrastructure
Technical Note | PDF< 1 MB
Tumor exome sequencing with Illumina DNA Prep with Enrichment and the DRAGEN Platform
Application Note | PDF1 MB
Application Note | HTML | 5 versions
Basespace Sequencing Hub Apps Quick Guide
Brochure | PDF< 1 MB
DRAGEN Bio-IT Platform on BaseSpace Sequence Hub
Data Sheet | PDF1 MB
DRAGEN Germline Pipeline Specification Sheet
Data Sheet | HTML
High-resolution, high-throughput spatial transcriptomics of complex tissues
Application Note | PDF3 MB
Data Sheet | PDF | 5 versions
