TruSight Cancer

이러한 전문가 정의 시퀀싱 연구 패널은 다양한 암에 대한 소인과 연관된 94개의 유전자 및 284개의 SNP를 표적으로 합니다.

1.5일

Assay 시간

5시간

수작업 시간

DNA 50 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

암 유전체학 전문가들과의 협업으로 개발된 이 사전 설계되고 바로 사용 가능한 올리고는 연구자들이 이전에 암 소인과 관련이 있었던 다양한 유전자와 단일 염기 다형성(SNP)을 시퀀싱하도록 지원합니다.

  • 암에 대한 소인과 연관된 94개의 유전자 및 284개의 SNP를 표적화

TruSight Cancer에는 일반암(예: 유방암, 대장암) 및 희귀암 둘 다와 관련되어 있는 유전자가 포함되어 있습니다. 또한 이 세트에는 유전체 차원의 연관성 연구(GWAS)를 통해 암과 상관관계가 있는 것으로 확인된 284개의 SNP가 포함됩니다. 콘텐츠 선발은 과학 문헌 및 기타 고품질 리소스의 전문가 큐레이션을 기반으로 했습니다.

TruSight Cancer 시퀀싱 패널은 식별된 관심 영역을 표적으로 하는 맞춤형 올리고를 제공합니다. 4개 인리치먼트(enrichment) 반응에 충분한 제품이 공급됩니다. TruSight Cancer는 TruSight Rapid Capture에 적합합니다.

TruSight Cancer 샘플 데이터 세트

6개의 인간 참조 샘플은 TruSight Cancer 시퀀싱 패널을 사용하여 준비되었습니다. 이러한 라이브러리는 듀얼 인덱싱을 통해 2 x 100 bp 리드 길이(read length)에서 high output 키트를 사용하여 MiSeq 시스템에서 시퀀싱했습니다. 총 수율은 5.2 Gb이고 염기는 Q30 이상에서 95.8%였습니다.

사양

필수 제품

필수 액세서리

또한 다음 인리치먼트 제품 중 하나 이상이 필요합니다.

/

응용법

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiniSeq 시스템

Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp

MiSeq 시스템

Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp

NextSeq 550 시스템

Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

MGZ Medical Genetic Center의 연구원들은 Infinium CytoSNP-850K BeadChip 및 TruSight Cancer Panel을 사용하여 염색체 이상을 분석하고 있습니다.

문서

제품 관련 자료

비교하기

TruSight Cancer TruSight Hereditary Cancer Panel AmpliSeq for Illumina BRCA Panel
Assay 시간 1.5일 DNA부터 데이터까지 약 48시간 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)
암 종류 전체 고형암 전체 고형암, 고형암 고형암
콘텐츠 사양 일반 및 희귀 암과 연관된 94개 유전자와 284개 SNP에 대해 인리치하는 고정된 프로브 세트. 113개의 암 위험 관련 유전자를 표적으로 함 BRCA1BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스
설명 일반 및 희귀 암에 대한 생식세포 돌연변이 검출 연구입니다. TruSight Hereditary Cancer Panel은 식별 목적 및 다유전자 위험 점수를 위해 113개의 유전자 및 125개의 단일 염기 다형성(SNP)에 걸친 생식세포 돌연변이를 평가하도록 설계된 표적 시퀀싱 패널입니다.  BRCA1BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다.
수작업 시간 5시간 약 2시간 <1.5시간
사용량 DNA 50 ng DNA 50~1000 ng  1~100 ng(풀당 10 ng 권장)
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NextSeq 500 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱
멀티플렉싱 최대 96플렉스 이중 인덱스 조합 96개
핵산 종류 DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 FFPE 호환 불가, FFPE 호환 불가 혈액, 타액 혈액, FFPE 조직
종 카테고리 인간 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 생식세포 변이 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel)

인리치먼트 패널 (12)

TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

TruSight Cancer는 다양한 암에 대한 소인과 관련된 94개 유전자 및 284개 SNP를 표적으로 하며, 단일 하이브리드화 워크플로우로 인해 Nextera Flex for Enrichment와 함께 사용하면 8가지 인리치먼트 반응에 충분하고 TruSight Rapid Capture와 함께 사용하면 4가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96개의 라이브러리(8개의 12플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터는 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16개의 라이브러리(16개의 1플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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TruSight Rapid Capture (1 index, 8 samples, 8 enrichments)

FC-140-1101

8개의 1-플렉스 증균을 통해 최대 8개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 1개의 고유 인덱스 조합을 포함합니다.

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TruSight Rapid Capture (2 indexes, 8 samples, 4 enrichments)

FC-140-1102

4개의 2-플렉스 증균을 통해 최대 8개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 2개의 고유한 인덱스 조합을 포함합니다.

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TruSight Rapid Capture (4 indexes, 16 samples, 4 enrichments)

FC-140-1103

4개의 4-플렉스 증균을 통해 최대 16개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 4가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 48 samples, 4 enrichments)

FC-140-1104

4개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 48개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 24가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 96 samples, 8 enrichments)

FC-140-1105

8개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 96개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 24가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (96 indexes, 288 samples, 24 enrichments)

FC-140-1106

24개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 288개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 96개의 고유한 인덱스 조합이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

생체표지자 특허 및 제품의 구체적인 용도가 고유한 다른 특허에 대한 주석:
일부 핵산 시퀀스 및 특정 애플리케이션에서의 사용을 포함한 일부 유전체 변이는 특허에 의해 보호될 수 있습니다. 고객이 특정 애플리케이션에서 제품을 사용하기 위해서는 그러한 특허를 보유하거나 관리하는 당사자로부터 라이선스를 획득해야 하는지 여부를 확인하는 것이 좋습니다.

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