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TruSight Oncology 500 High-Throughput

모든 주요 변이 분류와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI)를 다루는 대형 전암 패널을 통해 추가된 확장성으로 CGP를 지원합니다.

검체에서 결과까지 4~5일

Assay 시간

자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간. 수동 워크플로의 경우 ~10.5시간.

수작업 시간

40 ng DNA 및/또는 40~80 ng RNA

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

이제 NovaSeq X 시리즈, NextSeq 1000 시스템 및 NextSeq 2000 시스템에서 지원됩니다

개요

TruSight Oncology 500 High-Throughput (HT)은 자체 FFPE 조직의 포괄적인 유전체 프로파일링(CGP)을 지원하는 매우 확장성 있는 전체 고형암, 차세대 시퀀싱(NGS) assay입니다.  

  • 523개 유전자를 표적으로 하여 모든 DNA 및 RNA 변이 유형(SNV, CNV, 삽입/결실, 유전자 융합)과 MSI 및 TMB를 평가합니다 

  • 하이브리드 캡처 케미스트리 및 정교한 생물정보학으로 정확한 결과를 제공합니다 

  • 수작업 시간을 줄이고 옵션 자동화 키트 및 방법으로 확장성 증가*

  • 런당 NextSeq 1000 및 2000 시스템으로 8~36개 샘플, NovaSeq 6000으로 16~192개 샘플, NovaSeq X 시리즈로 32~960개 샘플을 처리합니다

유의미한 결과

가이드라인 및 임상시험에 부합하는 > 500개의 전체 고형암 생체표지자를 평가하여 단일 assay로 양성 생체표지자를 찾을 가능성을 높입니다.  

간소화된 워크플로우

Illumina Connected Analytics로 온프레미스 서버를 통해 또는 클라우드에서 바로 사용 가능한 DRAGEN 2차 분석 파이프라인과 통합된 수동 또는 자동 워크플로우를 사용하여 4~5일 만에 결과를 얻으세요. Illumina Connected Insights† 또는 Velsera Clinical Genomics Workspace(CGW)를 통해 통합 해석 보고서에 접근합니다. 

* 자동화는 Beckman Coulter iSeries 또는 Hamilton Microlab STAR에서 이용 가능합니다. 더 자세한 정보는 Illumina 영업담당자에게 문의하시기 바랍니다.

†일부 국가에서는 판매하지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다. 

포괄적인 포트폴리오로 CGP 지원

TruSight Oncology 500 제품군으로 임상 연구를 위한 관련 생체표지자를 식별합니다. 

TruSight Oncology 500 High-Throughput

한 번에 최대 960개의 샘플을 하나의 배치로 묶어 TruSight Oncology 500과 동일한 패널 콘텐츠와 조직 입력 유형을 사용할 수 있습니다.

TruSight Oncology 500

유전체 불안정성 점수(GIS)를 평가하기 위한 액세서리 키트를 통해 이제 HRD(상동 재조합 결핍)를 포함하여, FFPE 종양 조직에서 추출한 관련 DNA 및 RNA 암 생체표지자를 평가합니다.‡ 

TruSight Oncology 500 ctDNA

TruSight Oncology 500과 유사한 DNA 패널 콘텐츠로 액체 생검을 통해 혈장에서 순환 종양 DNA(ctDNA)를 분석합니다. 

TruSight Oncology 500 제품군에 대해 더 알아보기

‡ HRD는 TruSight Oncology 500 HRD Kit를 TruSight Oncology 500에 추가한 경우에만 사용 가능합니다. 일본에서는 판매되지 않습니다. 

§ NextSeq 1000 시스템, NextSeq 2000 시스템, NovaSeq 6000Dx Instrument(연구 모드) 및 NovaSeq X 시리즈에는 2차 분석을 위한 별도의 독립형 DRAGEN Server가 요구됩니다.

사양

Assay 시간 검체에서 결과까지 4~5일
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 종류 전체 고형암, 고형암
콘텐츠 사양 총 1.94Mb 패널 크기로 523개의 관심 대상 유전자에서 얻은 DNA와 55개의 유전자에서 얻은 RNA의 표적 염기서열분석. MSI 및 TMB 측정 포함. 
설명 NovaSeq 6000 시스템 또는 NovaSeq 6000Dx 기기(연구 모드)를 사용하여 간소화된 워크플로우에서 가이드라인 및 > 1K 임상시험의 주요 생체표지자를 식별하기 위한 고처리량 종합 NGS 분석. 면역종양학 생체표지자 MSI 및 TMB의 범위를 포함한다.
수작업 시간 자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간.
수동 워크플로의 경우 ~10.5시간.
사용량 40 ng DNA 및/또는 40~80 ng RNA
기기 NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
Multiplexing NextSeq 1000 and 2000: P2 flow cell 8 samples, P3 flow cell 24 samples, P4 flow cell 36 samples.
NovaSeq 6000/Dx: SP flow cell 16 samples, S1 flow cell 32 samples, S2 flow cell 72 samples, S4 flow cell 192 samples.
NovaSeq X Series*: 1.5B cartridge 32 samples, 10B cartridge 192 samples, 25B 480 samples.
핵산 종류 DNA, RNA
Sample throughput NextSeq 1000 and 2000: 8–36 samples/run. NovaSeq 6000/Dx: 16-192 samples/run. NovaSeq X: 32–480 samples/run. NovaSeq X Plus: 32-960 samples/run.
특수 샘플의 종류 FFPE 조직
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 구조적 변이, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

*표시된 처리량은 싱글 플로우 셀 NovaSeq X System용입니다. NovaSeq X Plus는 두 배의 용량을 가진 이중 흐름 셀 시스템을 제공합니다.

필수 제품

TruSight Oncology 500 High-Throughput(TSO 500 HT)을 실행하려면 다음이 필요합니다.

DRAGEN 변이 검출 파이프라인을 분석하려면 다음이 필요합니다.

최종 보고서를 생성하려면 다음이 필요합니다.

§NextSeq 1000, NextSeq 2000, NovaSeq 6000Dx(연구 모드) 및 NovaSeq X 시리즈에는 2차 분석을 위한 별도의 독립형 DRAGEN Server가 요구됩니다.

†일부 국가에서는 판매하지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

/ 건

애플리케이션

TruSight Oncology 500 High-Throughput (HT)은 FFPE 종양 샘플의 포괄적인 유전체 프로파일링을 지원하므로 플로우 셀당 8~480개의 샘플까지 증가된 확장성으로 매우 다양한 생체표지자를 평가할 수 있습니다.

워크플로우 예시

1
준비

TruSight Oncology 500 High-Throughput assay 

2
시퀀싱
3
분석

변이 검출: 

인사이트 및 보고: 

Illumina Connected Insights**  

Velsera Clinical Genomics Workspace 소프트웨어

** 일부 국가에서는 판매하지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NextSeq 1000 시스템, NextSeq 2000 시스템

런당 샘플 수 8개(P2 플로우 셀), 8억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 24개(P3 플로우 셀), 24억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 36개(P4 플로우 셀), 36억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

2 x 101 bp
NovaSeq 6000 시스템

런당 샘플 수 16개(SP Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지 

런당 샘플 수 32개(S1 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지 

런당 샘플 수 72개(S2 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지 

런당 샘플 수 192개(S4 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지 

2 × 101 bp 
NovaSeq 6000Dx(Research Mode)

런당 샘플 수 16개(SP Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 32개(S1 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 72개(S2 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 192개(S4 Flow Cell), 1억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

2 × 101 bp
NovaSeq X 시스템

런당 샘플 수 32개(15억개의 플로우 셀), 32억 개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 192개(100억개의 플로우 셀), 200억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

런당 샘플 수 480개(250억개의 플로우 셀), 520억개의 페어드 엔드 리드, 3,500배 커버리지

*표시된 처리량은 단일 흐름 셀 NovaSeq X 기기용입니다.
NovaSeq X Plus는 두 배의 용량을 가진 이중 흐름 셀 시스템을 제공합니다.

2 × 101 bp

관련 애플리케이션 및 방법

라이브러리 프렙 자동화

Illumina 자동화 협력사를 통해 제공되는 대용량 및 저용량 초간편 자동화 프로토콜로 수작업 시간을 단축하고 오류를 최소화하세요.

면역 종양학 연구

면역 종양학 연구자들은 차세대 시퀀싱을 통해 면역요법 반응 인자 및 종양의 면역감시 회피 메커니즘에 대한 인사이트를 얻을 수 있습니다.

병리학 및 임상 암 연구

Illumina의 임상 암 연구 솔루션은 정확한 유전체 정보를 제공하고 검사실에서 단일 검사를 통해 여러 유전자를 분석할 수 있습니다.

문서

제품 관련 자료
  • Product Information Sheet PDF < 1 MB
    2 버전
지원 문서

비교하기

TruSight Oncology 500 High-Throughput TruSight Oncology 500 v2 TruSight Oncology 500 ctDNA v2
Assay 시간 검체에서 결과까지 4~5일 3–4 days from sample input to final results 2.5–4 days from purified nucleic acid to variant results
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 Explore available automation methods
암 종류 전체 고형암, 고형암 전체 고형암, 고형암 전체 고형암, 고형암
콘텐츠 사양 총 1.94Mb 패널 크기로 523개의 관심 대상 유전자에서 얻은 DNA와 55개의 유전자에서 얻은 RNA의 표적 염기서열분석. MSI 및 TMB 측정 포함.  Targeted sequencing of DNA for a total of 1.94 Mb panel size: 523 genes for small variants, 59 genes for CNVs, 23 genes for gene rearrangements, bMSI (> 2300 loci), bTMB (1.94 Mb).
설명 NovaSeq 6000 시스템 또는 NovaSeq 6000Dx 기기(연구 모드)를 사용하여 간소화된 워크플로우에서 가이드라인 및 > 1K 임상시험의 주요 생체표지자를 식별하기 위한 고처리량 종합 NGS 분석. 면역종양학 생체표지자 MSI 및 TMB의 범위를 포함한다. Enables comprehensive genomic profiling of solid tumors using DNA and RNA from FFPE tissue. Provides variant detection and biomarker assessment from a single sample for broad tumor characterization. Provides a noninvasive research method for comprehensive genomic profiling of liquid biopsy samples (ctDNA from blood plasma). This liquid biopsy approach provides insights about intra- and inter-tumor heterogeneity using a minimally invasive sample collection approach to complement tissue-based CGP.
수작업 시간 자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간.
수동 워크플로의 경우 ~10.5시간. 		~7 hrs for manual workflow ~1.5 hr for automated workflow
~2.5 hr for manual workflow
사용량 40 ng DNA 및/또는 40~80 ng RNA 30 ng DNA (as low as 10 ng), 40 ng RNA (as low as 20 ng) 20 ng cfDNA (4 ml of plasma)
기기 NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
Multiplexing NextSeq 1000 and 2000: P2 flow cell 8 samples, P3 flow cell 24 samples, P4 flow cell 36 samples.
NovaSeq 6000/Dx: SP flow cell 16 samples, S1 flow cell 32 samples, S2 flow cell 72 samples, S4 flow cell 192 samples.
NovaSeq X Series*: 1.5B cartridge 32 samples, 10B cartridge 192 samples, 25B 480 samples. 		NextSeq 550/Dx: 8 samples/run.
NexSeq 1000 and 2000: P2 flow cell 8 samples, P3 flow cell 24 samples, P4 flow cell 36 samples.
NovaSeq 6000/Dx: SP flow cell 16 samples, S1 flow cell 32 samples, S2 flow cell 72 samples, S4 flow cell 192 samples.
NovaSeq X/X+: 1.5 B 32 samples, 10B 192 samples, 25B 480 samples. 		NextSeq 2000 System: 4 samples on P4 flow cell.
NovaSeq 6000 System: 4 samples on S1 flow cell, 8 samples on S2 flow cell, 24 samples on S4 flow cell.
NovaSeq X Series: 4 samples on 1.5B flow cell, 24 samples on 10B flow cell, 64 samples on 25B flow cell.

핵산 종류 DNA, RNA DNA, RNA DNA
Sample throughput NextSeq 1000 and 2000: 8–36 samples/run. NovaSeq 6000/Dx: 16-192 samples/run. NovaSeq X: 32–480 samples/run. NovaSeq X Plus: 32-960 samples/run. 8–960 samples per run 4-48 samples/run
특수 샘플의 종류 FFPE 조직 FFPE 조직 순환 종양 DNA, 혈액
종 카테고리 인간 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 구조적 변이, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), Tumor mutational burden (TMB), Genomic instability score (GIS), Microsatellite instability (MSI) 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), 유전자 재배열

그림

DRAGEN TruSight Oncology v2와 로컬 앱 간 TMB 상태의 높은 일치성

DRAGEN TruSight Oncology v2와 로컬 앱 간 MSI 상태의 높은 일치성

DRAGEN TruSight Oncology v2와 로컬 앱 간 CNV(유전자 증폭) 검출의 높은 일치성

유전자 융합 및 스플라이스 변이의 강력한 검출

이 표에 들어 있는 정보는 TruSight Oncology 500과 TruSight Oncology 500 고처리량 간 일치성의 예를 보여주는 것이지, 검출된 유전자 융합 및 스플라이스 변이의 포괄적 목록이 아닙니다. 이 데이터는 로컬 앱 파이프라인으로 (DRAGEN 소프트웨어 아님) 생성되었습니다.

DRAGEN은 TruSight Oncology 500 2차 분석을 가속화합니다

CNV (Gene Amplification) Concordance

CNV(유전자 증폭) 일치성

TSO 500 HT용 NovaSeq X 시리즈와 NovaSeq 6000 간의 높은 일치성 

자원

축소판

TruSight Oncology 500 HT를 통한 자동화

Intermountain Precision Genomics의 고객들이 어떻게 CGP를 사용하고 자동화를 통해 워크플로우를 확장했는지 들어 보세요. 

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자주 묻는 질문

해당 시험 사이의 주된 차이점은 규모입니다. TruSight Oncology 500 HT는 NextSeq 1000 및 2000, NovaSeq 6000, NovaSeq 6000Dx(연구 모드의 경우) 및 NovaSeq X 시리즈 등 다양한 시퀀서에서 실행됩니다. 샘플 배치는 한 번에 8~960개까지 가능하며, 더 높은 샘플 처리량에 대한 확장성을 제공합니다. TruSight Oncology 500은 NextSeq 550 시스템 또는 NextSeq 550Dx 기기(연구 모드)에서 실행되며 한 번에 최대 8개의 샘플을 하나의 배치로 묶을 수 있습니다. 다른 차이점은 이 페이지에 있는 비교표를 참조해 보세요.

그렇습니다. Illumina Qualified 자동화 방법으로 TSO 500 HT 워크플로우를 자동화할 수 있습니다. Illumina Qualified 방법은 Beckman Coulter Life Sciences i7 및 Hamilton STAR(MOA 구성) 액체 처리 로봇에서 사용 가능합니다. Illumina Qualified 방법은 Illumina와 자동화 협력사에 의해 공동 개발되었습니다. 자동화에만 적용되는 라이브러리 프렙 키트는 자동화 플랫폼에서 요구되는 시약 용량 수용을 위해 Illumina에서 제공합니다.

TruSight Oncology 500 HRD는 현재 TruSight Oncology 500 고처리량에 사용되도록 유효성 평가가 되지 않았습니다. 대체 솔루션에 대한 정보는 현지 Illumina 영업담당자 또는 지원 담당자에게 연락하시기 바랍니다. TruSight Oncology 500 HRD는 일본에서는 지원되지 않습니다.

Illumina DRAGEN 2차 분석 플랫폼은 DRAGEN 이외 옵션 대비 두 배의 속도로 더 높은 변이 검출 정확성을 제공합니다.1 향상된 정확성을 바탕으로 샘플 QC, 복잡한 변이, 작은 변이, 융합, 스플라이스 변이에 대해 더 나은 성능을 제공하며 BRCA1/BRCA2에 대한 엑손 수준의 CNV 검출을 제공합니다. Illumina는 DRAGEN TruSight Oncology 500 파이프라인에 혁신적인 기능을 지속적으로 제공할 것입니다.

그렇습니다. 자체 소프트웨어로 분석을 수행하실 수 있습니다. 하지만 Illumina는 이 경우 직접적으로 기술 지원을 제공할 수 없습니다.

/ 건

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

혈액, 골수, FFPE 조직을 포함한 많은 RNA 샘플의 종류에서 유전자 발현, 변이, 유전자 융합 검출 연구를 위한 1,385개의 암 유전자를 표적으로 합니다.

NovaSeq 6000 Reagent Kit

즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 시스템용 시약 키트.

참고 문헌

  1. 데이터 산출은 기록에 기재되어 있습니다. Illumina, Inc. 2023.

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