NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Infinium Methylation Screening Array는 인구집단 건강 연구에 사용할 수 있는 저렴하고 크게 확장 가능한 후성유전체학 도구입니다.
Infinium Methylation Screening Array-48 키트
인구집단 건강 연구에 최적화된 확장성이 뛰어난 메틸레이션 어레이입니다. >1,000개의 샘플, 최대 수백만 개의 샘플 연구에 적합합니다.
개요
주요 기능
인간 인구집단에서 흔한 질병에 대해 매우 유익한 콘텐츠
탁월한 샘플 처리 효율성
신뢰할 수 있는 메틸레이션 데이터 및 간단한 인포매틱스
사양
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 |
|---|---|
| Description | Highly scalable and affordable methylation analysis of known common disease associations for population health applications. Ideal for studies >1,000 samples and up to millions of samples. |
| 사용량 | DNA 50 ng |
| 기기 | iScan System |
| 방법 | 메틸레이션 어레이 |
| 핵산 종류 | DNA |
| Number of samples | 48 samples per array |
| Sample throughput | 16,128 samples per week |
| 특수 샘플의 종류 | 사용량이 적은 샘플 |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 기술 | Microarray |
| 변이 클래스 | 차등 메틸화된 사이토신 |
필수 제품
Infinium Automated Pipetting System with ILASS 및 iScan은 EX 메틸레이션 워크플로우에 필요합니다. Infinium을 처음 사용하고 XT 스타터 키트가 아직 없는 고객에게는 Infinium EX/ XT 스타터 키트가 필요합니다. AutoLoader 2.x는 BeadChip을 iScan에 자동으로 사용하기 위한 옵션 장치입니다.
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건
애플리케이션
Methylation Screening Array는 인구집단 건강 연구를 위한 저렴한 대규모 후성유전학 분석을 지원합니다.
워크플로우 예시
관련 애플리케이션 및 방법
마이크로어레이와 NGS 기술을 사용한 유전체 차원의 메틸레이션 프로파일링 연구는 메틸레이션이 기능적으로 미치는 영향에 대한 새로운 인사이트를 제공할 수 있습니다.
Illumina는 후성유전학적 분석을 위한 솔루션을 제공합니다. Illumina의 도구를 사용하여 후성유전학적 변형과 유전자 조절에 미치는 영향에 대해 알아보세요.
메틸레이션 어레이를 사용하면 단일 뉴클레오티드 해상도로 유전체 전반의 메틸레이션 영역에 대한 고처리량 정량적 조사를 수행할 수 있습니다.
문서
비교하기
| Infinium Methylation Screening Array-48 키트 | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | |
|---|---|---|
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 | 자동 어레이 로더 |
| Description | Highly scalable and affordable methylation analysis of known common disease associations for population health applications. Ideal for studies >1,000 samples and up to millions of samples. | Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 전문적으로 선택된 향상된 기능성 콘텐츠를 갖춘 유전체(genome) 전체의 메틸레이션 스크리닝 도구입니다. 키트는 iScan 또는 NextSeq 550 Systems에서 처리되며, 샘플 풀링 및 인덱싱이 필요하지 않은 간단하고 사용이 용이한 워크플로우를 따릅니다. |
| 사용량 | DNA 50 ng | DNA 250 ng |
| 기기 | iScan System | NextSeq 550 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), iScan System |
| 방법 | 메틸레이션 어레이 | 메틸레이션 어레이 |
| 핵산 종류 | DNA | DNA |
| Number of samples | 48 samples per array | 어레이당 8개 샘플 |
| Sample throughput | 16,128 samples per week | 3024 samples per week on a single iSCAN |
| 특수 샘플의 종류 | 사용량이 적은 샘플 | 혈액, FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 인간 | 인간 |
| 기술 | Microarray | Microarray |
| 변이 클래스 | 차등 메틸화된 사이토신 | 차등 메틸화된 사이토신 |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림
재현성이 높은 메틸레이션 결과—(A) 메틸레이션 결과는 Infinium Methylation Screening Array와 Infinium MethylationEPICv2.0 BeadChip 간에 높은 상관관계가 있습니다. (B) 메틸레이션 결과는 Infinium Methylation Screening Array에서 분석된 복제 샘플 간의 우수한 재현성을 입증합니다.
Infinium Methylation Screening Array의 표지자는 다양한 형질 유형에 걸쳐 알려져 있는 형질 관련 CpG를 매우 풍부하게 포함하고 있으며, Methylation Screening Array(MSA)의 표지자는 Infinium MethylationEPICv2.0(EPICV2)의 형질 인리치먼트와 비교하여 나타낸 형질 연관성에 대한 증거를 기반으로 선택됩니다.
| Infinium Methylation Screening Array-48 인구집단 건강 연구를 위한 표적 메틸레이션 선별 검사 |
|
|---|---|
| 권장 애플리케이션 | 흔한 질병 연구(비암) 환경 역학 인구집단 유전체학 소비자 유전체학 |
| 콘텐츠 초점 | 알려진 흔한 질병 형질 연관성 알려진 환경 노출 연관성 세포 유형 특이적 메틸레이션 중간 메틸레이션 높은 MAF SNP를 측정하는 멀티오믹스 기능 |
| 총 메틸레이션 부위 | 270K |
| BeadChip당 샘플 수 | 48 |
| DNA 사용량 요건 | 50 ng |
| Assay chemistry | Infinium EX Methylation |
| 기기 지원 | iScan |
| iScan 시스템 최대 샘플 처리량a | 16,128개 샘플/주 |
| 액체 취급 자동화 | Infinium Automated Pipetting System with ILASS(필수) |
a 대략적인 수치, 스캔 시간 및 최대 처리량은 검사실 및 시스템 구성에 따라 다릅니다. 여기에 나열된 샘플 처리량은 AutoLoader 2.x 자동 어레이 로딩을 통합하여 달성됩니다.
Infinium Methylation Screening Array와 Infinium MethylationEPICv2.0 BeadChip 콘텐츠의 상위 수준 비교
| Infinium Methylation Screening Array | Infinium MethylationEPIC v2.0 | |
|---|---|---|
| 총 고유 부위 | 269,094 | 930,301 |
| CpG | 262,470 | 926,849 |
| Infinium 메틸레이션 어레이로부터 | 161,569 | - |
| 시퀀싱 연구 및 데이터베이스로부터 | 101,901 | - |
| CpH | 2,776 | 2,914 |
| Infinium 메틸레이션 어레이로부터 | 308 | - |
| 시퀀싱 연구 및 데이터베이스로부터 | 2,468 | - |
| SNP rsID | 3,848 | 538 |
| Infinium 메틸레이션 어레이로부터 | 64 | |
| 시퀀싱 연구 및 데이터베이스로부터 | 3,784 |
Infinium Methylation Screening Array에서 이전에 검증된 형질 관련 콘텐츠
| 형질 범주 | 형질 연관성을 표적으로 하는 프로브의 수 |
|---|---|
| 개발/노화 | 102,533 |
| 환경 노출 | 44,043 |
| 염증/자가면역 질환 | 41,894 |
| 혈통 | 31,843 |
| 성별 | 23,806 |
| 감염병 | 14,844 |
| 대사 질환 | 13,739 |
| 희귀 유전 질환 | 13,429 |
| 신경학적/신경발달 질환 | 8,874 |
| 신체 특성(신체 형태) | 8,109 |
| 정신 장애 | 7,280 |
| 심혈관 질환 | 7,007 |
| 생식 생물학/건강 | 6,999 |
| 신경퇴행성 질환 | 4,733 |
| 폐/호흡기 질환 | 1,748 |
| 신장 질환 | 982 |
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (48 samples)
20112611
Optimized methylation array with 270K markers for high-throughput common disease research & screening. Kit contains 1 48-sample BeadChip and all required reagents for processing 48 samples after bisulfite conversion. Requires iScan System and Infini
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (96 samples)
20112612
Optimized methylation array with 270K markers for high-throughput common disease research & screening. Kit contains 2 48-sample BeadChips and all required reagents for processing 96 samples after bisulfite conversion. Requires iScan System and Infin
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (1,152 samples)
20112613
Optimized methylation array with 270K markers for high-throughput common disease research & screening. Kit contains 24 48-sample BeadChips and all required reagents for processing 1,152 samples after bisulfite conversion. Requires iScan System and I
Methylation Screening Array semi-custom kits (3)
Inf Methyl Screening Array+ Kit (48 Spl)
20119540
Reagent kit for 48 samples. Contains 1 48-sample BeadChip and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
Inf Methyl Screening Array+ Kit (96 Spl)
20119541
Reagent kit for 96 samples. Contains 2 48-sample BeadChips and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
Inf Methyl Screening Array+ Kit (1152 Spl)
20119542
Reagent kit for 1,152 samples. Contains 24 48-sample BeadChips and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
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자주 묻는 질문
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 프로모터 및 인핸서에 집중된 콘텐츠로 >99% RefSeq 유전자를 다루는 약 930K CpG 영역을 갖춘 포괄적인 전장 유전체 발견 도구를 제공합니다. Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 최대의 발견 역량을 위해 모든 유전자 및 프로모터 영역에 걸친 메틸레이션 프로파일링이 요구되는 프로젝트에 이상적입니다. 또한 중요한 종양유전자 커버리지, FFPE 조직과의 적합성 및 유전자 복제수 변이 프로파일링 기능으로 인해 모든 종양학 애플리케이션에 이상적입니다.
Infinium Methylation Screening Array는 인구집단 건강 프로젝트를 위한 흔한 질병 연구용으로 보다 비용 효과적인 메틸레이션 선별 검사 도구를 제공합니다. 약 270K 메틸레이션 부위는 지난 10년간 전후성유전체 연관성 연구에서 알려진 형질 연관성뿐만 아니라 세포 유형 특이적 메틸레이션, 중간 메틸레이션, CoRSIV, SNP 등을 다루는 새로운 콘텐츠에 중점을 둡니다. Infinium Methylation Screening Array는 대규모 전후성유전체 연관성 연구(EWAS) 및 바이오뱅크 선별 검사 프로젝트에 이상적입니다.
포괄적인 제품 비교표는 Infinium Methylation Screening Array 데이터시트에서 찾아볼 수 있습니다.
예, Methylation Screening Array는 EX Methylation 워크플로우를 필요로 하는 반면 EPICv2.0은 HD Methylation 워크플로우를 사용합니다. EX Methylation은 48개 샘플 EX BeadChip 및 자동화를 통해 새로운 샘플 처리 효율성을 제공할 수 있고, DNA 입력이 50 ng로 낮습니다. EX Methylation 워크플로우는 자동화된 액체 취급을 위해 Infinium Automated Pipetting System with ILASS를 필요로 합니다.
Illumina 제품 manifest 파일은 기본적인 유전체 매핑 어노테이션을 제공하기는 하지만, Zhou Lab Infinium Annotations GitHub 페이지는 Infinium Methylation Screening Array에서 다루는 형질 연관성을 포함한 상세한 어노테이션을 제공합니다.
Infinium Methylation Screening Array는 다음과 같은 이유로 종양학 애플리케이션에 권장되지 않습니다.
· FFPE 적합성 검증되지 않음
· 널리 사용되는 암 분류자에 대한 프로브 커버리지가 충분하지 않음
· MGMT 프로모터 메틸레이션를 다루지 않음
· 유전자 복제수 변이를 프로파일링하는 능력이 제한됨
· BeadChip당 48개 샘플의 최소 배치 크기가 클수록 결과의 총 소요 시간이 길어질 수 있음
Illumina는 Methylation Screening Array에 내장된 Infinium 컨트롤을 분석하기 위해 사용이 용이한 도구를 제공합니다. 자세한 내용은 메틸레이션 어레이 데이터 분석 팁 페이지를 참조해 보세요.
예, 서비스 검사실은 GenomeStudio Methylation Module 컨트롤 대시보드를 사용하여 assay 성능을 평가할 수 있습니다. 다운스트림 메틸레이션 분석의 경우 SeSAMe와 같은 Bioconductor 패키지가 권장됩니다.
이 스캔은 BeadChip당 약 20분이 소요됩니다.
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건
MiSeq 시약 키트 v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
TruSight Oncology 500 v2
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
CpG 섬, 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 커버리지를 제공하는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이(microarray)입니다. 유전 및 희귀 질환 연구, 암 연구 및 분류에 이상적입니다.
Infinium Mouse Methylation BeadChip
다양한 뮤린 균주의 고해상도 후성유전학 분석을 위해 메틸롬 전반에서 > 285k 표지자를 특징으로 합니다.
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip
대규모의 표적 후성유전학적 애플리케이션을 위한 완전 맞춤형 메틸레이션 마이크로어레이.
Infinium Automation Option Packages
Infinium assay용 로봇 제어 소프트웨어를 사용한 자동화 옵션은 샘플 준비 워크플로우를 간소화하고 오류를 줄입니다.
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