MiSeq Reporter는 2차 분석을 시작하려면 다음과 같은 1차 분석 파일이 필요합니다. 소프트웨어는 런 폴더에서 이러한 파일에 자동으로 액세스합니다.
파일 종류 | 설명 |
---|---|
RTAComplete.txt | RTA 처리가 완료되었음을 나타내는 마커 파일. |
SampleSheet.csv | 시퀀싱 런 시작 시 제공. 분석 워크플로우 및 중요한 런 정보가 포함됩니다. |
RunInfo.xml | 높은 수준의 런 정보를 식별합니다. |
*.bcl 파일 | 파일에는 기본 통화 정보가 포함됩니다. |
*.필터 파일 | 파일에는 각 타일에 대한 필터 결과가 포함됩니다. |
*.locs 파일 | 파일에는 타일의 모든 클러스터 위치가 포함됩니다. |
데이터베이스 | 인간을 위한 miRbase 인간용 dbSNP 인간을 위한 refGene |
유전체 | 애기장대 소 대장균 균주 DH10b 인간(Homo sapiens ) 빌드 hg19 마우스 쥐 효모 황색포도상구균 |
FASTA 형식으로 자신의 레퍼런스를 업로드하고 사용할 수 있습니다. 참조 FASTA 파일은 단일 폴더에 저장해야 하며 *.fa 또는 *.fasta 확장자가 있어야 합니다.