품질 관리를 위한 iSeq 100 System 사용
Texas A&M AgriLife의 유전체학 및 바이오인포매틱스 책임자인 Charlie Johnson은 검사실에서 품질 관리를 위해 iSeq 100 시퀀싱 시스템과 NovaSeq 6000 Sequencing System을 페어링하는 방법과 iSeq 100 System이 워크플로우에 필수적인 것이 된 이유를 설명합니다.
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검사실에서 바로 사용하기 쉽고 경제적인 에코시스템에서 Illumina 차세대 시퀀싱(NGS) 기술의 고성능을 활용하세요.
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Illumina 포트폴리오에서 가장 경제적인 소형 벤치탑 시퀀싱 시스템에 대한 비하인드 스토리를 살펴보고 검사실에서 NGS의 고성능을 얼마나 쉽게 활용할 수 있는지 알아보세요.
상호보완하는 금속산화막반도체(CMOS) 기술의 속도와 경제성, 그리고 sequencing by synthesis(SBS) chemistry의 정확성을 활용하는 iSeq 100 System은 거의 모든 검사실에서 고성능 NGS 기술을 확보할 수 있게 해 줍니다.
iSeq 100 System은 qPCR 및 Sanger 시퀀싱에 비해 더 높은 데이터 분해능과 더 깊은 커버리지를 제공함으로써 결과까지의 시간을 단축하고 수작업 단계를 줄이면서 변이 또는 저빈도 대립유전자 호출에 대한 통계적 신뢰도를 높입니다.1,2
대규모 시퀀싱 시스템이나 아웃소싱에 비해 iSeq 100 System은 빠르고 비용 효율적인 소규모 런, 아웃소싱으로부터의 독립성, 처음부터 끝까지 시퀀싱 프로세스를 제어할 수 있는 기능을 제공합니다.
지원되는 최장 리드 길이의 최대 데이터 생성량이 1.2 Gb인 iSeq 100 System은 소규모 유전체 시퀀싱, 표적 유전자 시퀀싱, 유전자 발현 프로파일링을 포함한 다양한 DNA 및 RNA 시퀀싱 애플리케이션을 위한 신속한 멀티플렉싱 시퀀싱을 제공합니다.
Westmead Institute for Medical Research의 바이러스학 검사실 수석 과학자인 John-Sebastian Eden 박사는 자신의 시퀀싱 프로젝트를 사내로 가져왔습니다. 그가 iSeq 100 System을 결정한 이유와 과정에 대해 알아보세요.
iSeq 100 System은 포괄적이고 간소화된 워크플로우를 갖추고 있기 때문에 빠르고 비용 효율적인 유전자 분석을 수행하고자 하는 모든 검사실에 적합한 제품입니다.
Clarity LIMS 소프트웨어 또는 기존의 LIMS 시스템을 통해 워크플로우를 원활하게 관리해 보세요.
여러 가지 고성능 Library Prep Kit를 사용하여 라이브러리를 준비해 보세요.
입증된 Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry를 적용하여 최저 9.5시간 만에 바로 사용 가능한 시약으로 시퀀스를 생성해 보세요.
기기 탑재 소프트웨어인 Local Run Manager와 터치스크린 인터페이스를 사용하여 시퀀싱 런을 모니터링하고 분석합니다.
BaseSpace Sequence Hub에 있는 앱을 사용하여 결과를 해석하고 공유해 보세요.
iSeq 100 System은 런당 최대 1.2 Gb의 최대 데이터 아웃풋, 최적화된 library prep kit, 고해상도 및 분석 민감도를 통해, 작은 유전체 시퀀싱, 16S 메타지노믹 연구, 유전자 편집 유효성 검사 등 다양한 애플리케이션을 위한 다용도 옵션이 됩니다.
Texas A&M AgriLife의 유전체학 및 바이오인포매틱스 책임자인 Charlie Johnson은 검사실에서 품질 관리를 위해 iSeq 100 시퀀싱 시스템과 NovaSeq 6000 Sequencing System을 페어링하는 방법과 iSeq 100 System이 워크플로우에 필수적인 것이 된 이유를 설명합니다.
입증된 앰플리콘 chemistry가 업계를 선도하는 시퀀싱 기술을 만나 암 관련 표적 재시퀀싱 애플리케이션을 가능하게 합니다.
iSeq 100 시스템 |
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런 타임(범위) | 9~19시간 | 약 4~15.5시간 | 8~44시간 |
런당 최대 데이터 아웃풋 | 1.2 Gb | 30 Gb | 540 Gb |
런당 최대 싱글 리드 수 | 4M 개 | 100M 개 싱글 리드 200M 개 페어드 엔드 리드 |
1.8B 싱글 리드 3.6B 페어드 엔드 리드 |
데이터 분석 서비스b | BaseSpace Sequence Hub, Illumina Connected Analytics, 온프레미스 DRAGEN server | 기기 내: LRM 분석 모듈 클라우드: BaseSpace Sequence Hub 및 Illumina Connected Analytics에서 사용 가능한 DRAGEN 분석 애플리케이션의 광범위한 메뉴 온프레미스: 다양한 DRAGEN 분석 애플리케이션 메뉴 |
기기 내: DRAGEN 분석 파이프라인의 맞춤형 메뉴 클라우드: BaseSpace Sequence Hub 및 Illumina Connected Analytics에서 사용 가능한 DRAGEN 분석 애플리케이션의 광범위한 메뉴 온프레미스: 다양한 DRAGEN 분석 애플리케이션 메뉴 |
a. 최대 출력은 100M 플로우 셀 사양을 기준으로 합니다. 50M 및 100M 플로우 셀은 2025년부터 사용이 가능하며, MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.
b. 전용 DRAGEN Server는 Illumina 시퀀싱 시스템과 페어링되고, Illumina Run Manager를 사용하여 시퀀싱 런의 일부로 2차 분석을 계획하는 데 사용될 수 있습니다. 온프레미스 DRAGEN Server는 시퀀싱 시스템과 직접 통신하지는 않지만 커맨드 라인(command-line)을 통해 모든 Illumina 시퀀싱 시스템으로부터 받은 데이터를 입수 및 처리할 수 있습니다.
차세대 시퀀싱(NGS)에 대해 알아보고 시퀀싱 프로젝트 시작에 적합한 제품을 선택하는 데 도움이 되는 교육 및 지원 리소스를 찾아보세요.
단계별 가이드와 트레이닝 비디오를 통해 iSeq 100 System을 시작하는 방법을 알아보세요. NGS를 얼마나 손쉽게 검사실에 도입할 수 있는지 확인하세요.
NGS 데이터 분석 프로세스에서 대부분의 수작업 과정이 생략되었습니다. Local Run Manager 소프트웨어는 모든 iSeq 100 시스템에 설치되어 있으며 자동으로 기기 내 데이터 분석을 수행합니다. 이 소프트웨어는 시퀀싱 시작, 시퀀싱 상태 모니터링, 결과 확인 및 데이터 분석을 수행하는 사용이 용이한 터치스크린 인터페이스를 갖추고 있습니다.
iSeq 100 System은 혼자서도 쉽게 설치할 수 있습니다. 시작하는 데 도움이 되는 다양한 지원 리소스를 이용할 수 있습니다. Illumina 과학자와 엔지니어가 온라인 또는 대면으로 지원과 트레이닝을 제공하여 검사실 직원이 빠르게 적응할 수 있도록 돕습니다. 장기 유지 관리의 경우, 가동 중단 시간을 최소화하기 위해 교체 기기 또는 현장 서비스 엔지니어 지원(지역에 따라 다름)이 포함된 1년 보증이 적용됩니다.
참고 문헌
검사실이 이 작고 강력한 벤치탑 시퀀싱 시스템의 혜택을 받을 수 있는지 결정하는 데 도움을 받으세요. iSeq 100 시스템에 대한 자세한 내용은 지금 문의해 주세요.
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