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MiSeq i100 시리즈 사양

빠르고 유연한 시퀀싱

짧은 실행 시간, 확장 가능한 출력 및 탁월한 데이터 품질

벤치탑의 MiSeq i100 시스템

다양한 리드 길이에서의 플로우 셀당 데이터 아웃풋a,c

리드 길이란 무엇인가요? 시퀀스 리드 길이(Sequence read length)는 시퀀싱된 각각의 DNA 절편의 길이를 의미하며, 시퀀싱되는 말단이 한쪽인지 양쪽인지를 나타냅니다. 예를 들어, 2 × 150 bp 런(run)은 각 DNA 절편에서 150 염기쌍(base pair) 길이의 리드(순방향 및 역방향) 2개를 생성합니다. 긴 리드 길이는 반복 DNA 시퀀스를 포함할 확률이 높고, 짧은 리드 길이는 광범위한 유전체 커버리지를 필요로 하지 않는 카운팅 수행 시 비용 효과적으로 활용할 수 있습니다.

리드 길이에 대해 더 알아보기
플로우 셀 종류 5M 25M 50Mb 100Mb
1 × 100bp — 2.5Gb 5Gb 10Gb
2 × 150bp 1.5Gb 7.5Gb 15Gb 30Gb
2 × 300 bp 3Gb 15 Gb 30Gb —
2 × 500 bp — 25Gb — —
  1. 해당 사양은 공식적으로 권장되는 클러스터 밀도(cluster density)에서 Illumina의 PhiX Control 라이브러리로 얻은 수치를 근거로 합니다.
  2. 50M 및 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.

플로우 셀당 필터 통과 리드 수

필터 통과 리드(Reads passing filter)는 chastitya 필터를 통과한 클러스터(cluster)의 백분율을 의미하며, 각각의 필터를 통과한 클러스터는 1개의 리드(즉, 싱글 엔드 리드(single-end read))또는 2개의 리드(즉, 페어드 엔드 리드(paired-end read))를 제공합니다. 25사이클까지 1개 이상의 베이스 콜(base call)의 Chastity 값이 0.6 미만인 경우, 클러스터는 필터를 통과합니다. 싱글 엔드 런은 한쪽 말단에서만 DNA를 시퀀싱하는 경제적인 대안입니다. 반면 페어드 엔드 런은 간편하게 재배열(rearrangement), 새로운 전사물(novel transcript) 등을 분석할 수 있도록 DNA의 양쪽 말단을 모두 시퀀싱합니다.

필터를 통과하는 리드에 대해 더 알아보기
플로우 셀 종류 5M 25M 50Mb 100Mb
싱글 리드 수 5M 개 25M 개 50M 개 100M 개
페어드 엔드 리드 수 10M 개 50M 개 100M 개 200M 개
  1. Chastitiy(신호 순도)는 가장 밝은 염기 강도(base intensity)의 비율을 가장 밝은 염기 강도와 두 번째로 밝은 염기 강도의 합으로 나눈 값입니다.
  2. 50M 및 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.

Q-Scorea

Q-Score(Quality score, 품질 점수)는 베이스 콜링(base calling) 시 오류가 발생할 확률을 예측한 점수입니다. Q-Score가 높을수록 오류 발생 확률이 낮습니다. Q30은 1/1,000의 오류율, 즉 99.9%의 베이스 콜 정확도를 나타냅니다.

시퀀싱 Q-Score에 대해 더 알아보기
플로우 셀 유형 5Mb 25Mb 50Mc 100Mc
1 × 100 bp Q30 이상의 염기 ≥ 90%
2 × 150 bp Q30 이상의 염기 ≥ 90%
2 x 300 bp Q30 이상의 염기 ≥ 85%
2 x 500 bp Q30 이상의 염기 ≥ 85%
  1. 전체 시퀀싱 런에 걸쳐 Q30 이상인 염기의 백분율의 평균을 산출한 값입니다. Q-Score는 Illumina의 PhiX Control 라이브러리를 사용해 MiSeq i100 시리즈 시약으로 얻은 수치를 근거로 합니다.
  2. 50M 및 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.

런 타임

시퀀싱 런 타임(run time)은 클러스터 생성, 온보드 변성, 시퀀싱, 베이스 콜링 및 품질 채점 시간을 포함합니다.

플로우 셀 종류 5M 25M 50Ma 100Ma
1 × 100bp — 약 4시간 약 4.5시간 약 5시간
2 × 150 bp 약 7시간 약 7시간 약 7.5시간 약 8시간
2 × 300 bp 약 15시간 약 15시간 약 15.5시간 —
2 × 500 bp — 약 24시간 — —
  1. 50M 및 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.

주요 애플리케이션별 예상 샘플 처리량

샘플 처리량(Sample throughput)은 1회의 런을 통해 플로우 셀당 시퀀싱 가능한 샘플의 개수를 의미합니다.

    플로우 셀당 처리 가능한 샘플의 수
애플리케이션 샘플당 리드 수 5M 25M 50Ma 100Ma
전사체학 연구
3’ 유전자 발현 1~5백만 개 1~5 개 5~25 개 10~50 개 25~100 개
표적 RNA 패널 1~5백만 개 1~5 개 5~25 개 10~50 개 25~100 개
mRNA-Seq 천~2천5백만 개 — 1~2 개 1~5 개 1~10 개
Total RNA-Seq 5천만 개 — — 1 개 1~2 개
미생물 유전체학 연구
병원체 검출 50만~백만 개 1~10 개 1~50 개 1~100 개 1~200 개
16S 앰플리콘 시퀀싱 10만~20만 개 1~50 개 1~250 개 1~384 개 1~384 개
낮은 뎁스 메타지노믹스 (Shallow shotgun metagenomics) 50만~백만 개 1~10 개 1~12 개 1~25 개 1~50 개
샷건 메타지노믹 천~2천5백만 개 — 1~2 개 1~5 개 1~10 개
소형 WGSb 5십만 개 1~10 개 1~50 개 1~100 개 1~200 개
표적 유전자 시퀀싱
앰플리콘 기반 10만~5천만 개 1~5 개 1~250 개 1~384 개 1~384 개
인리치먼트 기반 10만~5천만 개 1~50 개 1~250 개 1~384 개 1~384 개
유전체 편집 10만~5천만 개 1~50 개 1~250 개 1~384 개 1~384 개
면역 레퍼토리 2천만~2천5백만 개 — 1~12 개 1~25 개 1-50 개
품질 관리
라이브러리 QC   > 0.02M 개 최대 384-plex 개 최대 384-plex 개 최대 384-plex 개
  1. 50M 및 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.
  2. 샘플당 리드 수는 평균 5 Mb 크기의 세균 유전체에 대한 최소 30× 커버리지를 기준으로 추정한 것입니다.

기기 사양

MiSeq i100 specifications
검사실에서 보기
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MiSeq i100 시리즈 사양a

  • 데이터 아웃풋b
    1.5~30Gb
  • 런당 페어드 엔드 리드
    10~200M 개
  • 최대 리드 길이
    2 × 500 bp
  • 런 타임
    약 4~24시간
  1. 해당 사양은 공식적으로 권장되는 클러스터 밀도(cluster density)에서 Illumina의 PhiX Control 라이브러리로 얻은 수치를 근거로 합니다.
  2. 최대 데이터 아웃풋은 100M 플로우 셀을 기준으로 합니다. 100M 플로우 셀은 MiSeq i100 Plus 시스템에서만 사용할 수 있습니다.
MiSeq i100 상세 사양 보기

핵심 기술

실온 배송/보관 시약

시약이 실온 배송 및 보관되므로 바로 개봉하여 시퀀싱할 수 있어 시퀀싱 셋업 시간이 짧아집니다.

Index-First 시퀀싱

Index-First 시퀀싱으로 초반에 빨리 디멀티플렉싱(demultiplexing)을 진행하고 실시간으로 런을 관리해 보세요.

XLEAP-SBS chemistry

XLEAP-SBS chemistry는 Illumina의 시퀀싱 chemistry 중 가장 빠르고 가장 강력하며 가장 높은 품질을 제공합니다.

바로 사용할 준비가 되어 있는 카트리지

플로우 셀과 유체가 모두 1개의 카트리지에 들어 있어 셋업이 간편하며 워시의 필요성을 없애 줍니다.

간소화된 바이오인포매틱스

온보드 또는 클라우드에서 사전 구성된 DRAGEN 파이프라인을 이용해 데이터 분석 단계를 간소화할 수 있습니다.