Skip to content

信息学基础架构和流程设置

合适的设施使发现成为可能

简化生物信息学和数据分析流程,让您专注于重要的工作

生物信息学基础架构和流程考虑因素

如果下一个重大突破与基因组学无关,但却改变了分析基因组数据的生物信息学流程怎么办?在Illumina,我们相信,您设置的生物信息学基础架构——从测序仪到分析工具都对成功极为重要。

无论现在还是未来,生物信息学和基因组学数据分析的跨学科属性要求建立一个有助于合作,并能最有效可靠地处理和分析基因组数据的生物信息学流程。设置一个全新的新一代测序(NGS)系统或简单地向已有系统添加内容需要仔细考虑和计划。

构建还是购买信息学工具?

从权威供应商处购买现成生物学工具,还是自建自定义的系统,实验室通常会权衡两者之间的利弊。自行开发系统的成本往往高于购买LIMS的成本,而以用户为中心开发的商业软件通常更便于工作人员使用。

许多实验室认为,如果能找到满足大部分需求、且能灵活地自定义系统配置、很好地支持实验室应用的LIMS,购买则是对资源的更好利用。

了解最近选择购买LIMS系统的实验室的经验。

阅读文章

实验室自动化的益处

引入自动化可解决高通量基因组学实验室面临的一些常见挑战,例如确保一致性和重现性。LIMS提供:

  • 样本追踪和标准化报告功能
  • 自动化的文库制备
  • 将仪器和液体处理机器人整合到工作流程中
  • 样本、测试和结果的端到端管理
深入了解LIMS

自动化的文库制备解决方案

我们与优秀的液体处理机器人供应商合作,从而在实验室中实现测序文库制备的自动化。供应商提供了用于各种Illumina试剂的方法,指导用户逐步完成实验方案选择和工作流程设置。这些实验室自动化方法省去了自行开发自动化程序所需的时间和精力。

例如,用户可通过开始屏幕上的按钮选择所需的实验方案。分步操作指南可避免在设置过程中可能发生的错误,保证初始条件准确无误。在屏幕上显示摘要,作为开始运行前的最后检查,这样实验室的每一个人都能方便地使用仪器。

深入了解文库制备自动化
自动化实验室日常流程的原因

LIMS的新用户强调实验室自动化软件如何帮助优化繁琐的工作流程并提高通量。

阅读访谈录

测序实验室自动化

了解旨在满足大规模基因组分析实验室需求的解决方案,从生产规模的测序仪到多重分析等。听听已建立大容量测序和自动化工作流程的科学家的讲述。

了解有关高通量测序的更多信息

芯片实验室自动化

我们为进行基于芯片的基因分型和甲基化研究的实验室提供液体处理机器人、芯片上样机和其他自动化套装。这些套装有助于简化测定工作流程并整合样本制备和芯片扫描流程。

深入了解高通量基因分型
了解芯片自动化套装
专为基因组学实验室设计的LIMS

BaseSpace Clarity LIMS是我们的实验室信息管理系统。本系统专为基因组学实验室设计,并针对NGS进行了优化。BaseSpace Clarity LIMS可与仪器整合,帮助实验室追踪和管理样本,并简化实验室的整体操作。与复杂的自建系统相比,BaseSpace Clarity LIMS在设计时充分考虑了终端用户的感受,便于实验室人员更迅速地掌握操作方法。

查看产品

数据共享与合作

准备发表数据

一直以来,测序数据难以被生物信息学专家以外的人员理解。Illumina解决方案提供直观的报告格式,专为生物学家定制,可用于发表论文。

研究人员可以一键启动工作流程,输出用户友好的报告,其文件格式可方便地与合作者或公共数据库共享。

了解文件格式
合作

共享大量数据一直以来都不理想,其中涉及复杂的FTP协议、硬盘限制和设备接口不兼容等问题。

Illumina Connected Analytics和BaseSpace Sequence Hub使与信任的合作者共享数据变得极其简单。用户只需点击按钮,即可分享单次测序运行或整个项目。数据可随时随进行共享和访问。

共享解决方案

用于基因组分析的应用程序

BaseSpace Sequence Hub App为四种最常见的生物学应用简化了基因组数据。

阅读数据表
BaseSpace Sequencing Hub

用于NGS数据管理和分析的Illumina云端基因组学计算环境。该平台通过简化的数据共享促进合作和创新。

了解更多
BaseSpace Clarity LIMS

LIMS能帮助实验室追踪样本,并优化工作流程。实验室管理员可以从移动设备访问实时数据并及时告知利益相关者或合作者。

了解更多

样本管理

轻松管理样本和设置实验

高通量基因组学实验室通常会面临管理/跟踪样本和设计定制检测的难题。我们提供的用户友好型工具可助您更好地启动和管理测序和芯片项目。

该信息学工具可帮助您导入生物学样本信息、设计和合并文库、准备测试运行、创建定制靶向测序panel以及生成样本表。

高通量实验室的样本管理

现代基因组学研究所生成的数据量非常惊人。随着数据量和样本通量的不断增加,实验室需要一种更为现代化的方式,以简化实验室操作并降低成本。

实验室信息管理系统(LIMS)是一款协助您高效管理样本和相关数据的软件。通过这款软件,实验室可实现工作流程自动化和仪器整合,实验室效率大大提高。

深入了解LIMS

简单的测序实验设置

使用Illumina测序系统专业软件可轻松设置和运行测序实验,用户可根据所使用的Illumina测序仪选择合适的软件工具。

NextSeq系列和MiniSeq测序系统:

BaseSpace Sequence Hub软件中的“准备”选项卡可简化样本和运行管理。该软件能够以图表的形式更为直观地提供一站式文库、运行准备服务。

NovaSeq、HiSeq或MiSeq测序系统:

Illumina Experiment Manager软件应用程序可指导您在测序仪运行前创建样本表,其内置验证检查功能可帮助您最大程度减少样本表错误。

Alt Text

标准品和质量控制的重要性

随着NGS技术的快速发展,对所生成的海量数据进行质量控制是很关键的一步。Illumina提供了在测序实验中使用对照DNA标准品的指南,帮助研究人员获得可靠的数据和实验结果。

了解更多

测序文件格式

从FASTQ和BCL文件格式到原始测序文件转换,我们的工具可提供成功的二级或三级分析所需的NGS数据格式。

测序实验设置

BaseSpace Sequence Hub、Illumina Experiment Manager和BaseSpace Clarity LIMS的“准备”选项卡使设置和运行测序实验比以往更轻松。

实验室信息管理系统(LIMS)

了解什么是LIMS,它如何帮助基因组学实验室进行样本追踪、工作流程自动化及下游数据分析。