研究整个群落的基因组

更好地理解微生物在人类健康和疾病中的作用

人类微生物组分析

人类微生物组分析是对人体表面及体内微生物群落的研究。人类微生物组分析旨在了解微生物对健康和疾病的影响。

在以前,研究人类的皮肤、粪便或血液样本需要培养和分离单个生物,然后进行表型或基因型分析,这种微生物学技术费时费力。而且这些方法无法在单个样本中进行微生物群落分析。 人类微生物组分析简介

Introduction to Human Microbiome Analysis

新一代测序(NGS)的出现催生了几个重大研究合作项目,包括人类微生物组计划MetaHIT,这些项目以NGS作为基础工具,发表了大量人类微生物组的相关数据。

NGS的高通量和成本的降低促进了宏基因组学研究,该研究能够研究整个群落的基因组,包括那些无法培养的生物体的基因组。

用于分析人体微生物组的实验性NGS方法包括:
鸟枪法宏基因组测序
  • 一种DNA测序方法,能够对给定的复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面的检测。
16S rRNA测序
  • 一种16S核糖体RNA基因测序方法,用于鉴定和比较给定样本中的细菌。
微生物宏转录组学
  • 对复杂样本中的一组微生物编码的所有RNA进行分析。
微生物组研究的基因水平宏基因组学
Metagenomics Data Sets

此在线讲座介绍了一种新的基因水平的生物信息学方法,用于从宏基因组测序数据集中识别与人类疾病相关的微生物物种和菌株。Samuel Minot博士还展示了一个交互式微生物组发现门户网站。

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高宿主量和低生物量样本中的微生物组测序
Microbiome Sequencing

此在线讲座探讨了新的测序方法,包括产生合成长read的方法,重点讨论了它们与微生物群落分析的相关性。Stefan J. Green博士介绍用于高宿主量和低微生物量样本问题的实用方法。

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在进行微生物转录组学研究时去除rRNA

Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit可在进行RNA-Seq前去除rRNA,让您专注于转录组的高价值部分。该技术说明展示了该试剂盒在微生物分离物和群落样本中去除rRNA的能力,并与之前版本的试剂盒进行了比较。

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Microbial Transcriptomics with rRNA Depletion

人类微生物组研究案例

 
The Time is Now for Microbiome Studies
进行微生物组研究的最佳时机

全基因组鸟枪法测序和转录组学为研究人员和制药公司提供了重要数据,可助其改进药物的发现和开发。

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Sequencing a Mouthful of Microbes
对口腔微生物进行测序

MiSeq系统让Saca la Lengua项目研究小组能够对数千个样本进行测序,以鉴定人类口腔中的各种细菌和真菌。

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NGS is Revealing the Mysterious World of Microbes
NGS揭示微生物的神秘世界

Microba的研究人员研究了微生物的基因组,增进了我们对人类健康、疾病和微生物进化的理解。

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Rob Knight博士带你了解微生物组

了解人微生物,生活在我们身体中的小型单细胞生物的群落如何对我们的健康产生巨大——并且很大一部分未知——的影响。

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Understanding your Microbiome with Dr. Rob Knight
探索NextSeq 2000

NextSeq 2000支持高通量测序应用。该系统历经75次以上的更新,采用干仪器和简捷的运行设置,可利用机载DRAGEN软件实现快速的二级分析。您可以通过该仪器体验我们最简单的工作流程,了解外显子组测序、靶向富集、单细胞分析和转录组测序的强大功能。

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了解如何设计微生物组研究,在给定的研究预算内更大程度的提高效力和成功几率,并深入了解个性化膳食与微生物组的相互作用会如何影响研究结果。

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A Guide to Diet-Microbiome Study Design

人类微生物组相关研究

Cancer Microbiome Research
癌症微生物组学研究

微生物群落可影响宿主免疫反应、癌症进展和治疗有效性。随着基于NGS的研究继续探索宿主与微生物组的相互关系,希望有关人类微生物组的信息对免疫疗法策略有所影响。

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How Microbiome Multi-Omics Can Bolster Human Health
微生物组多组学如何促进人类健康

测序技术可对肠道微生物组进行更深入的分析。研究人员现在可以探索我们体内微生物群落的作用,以及它们如何促进或预防疾病。

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MiSeq, 16S rRNA Sequencing and the American Gut Project
MiSeq、16S rRNA测序和美国肠道计划
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Composition and Dynamics of the Human Gut Virome<
人类肠道病毒组的组成和动力学
观看视频
Microbial Sequencing for Microbiome Studies
用于微生物组研究的微生物测序

查看如何使用Illumina NGS对复杂微生物群落进行测序。

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Metagenomics for Virus Discovery on Skin
用于皮肤病毒研究的宏基因组学

Illumina测序仪提供了更高的覆盖度,可以确定与非黑色素瘤皮肤癌相关的HPV新类型。

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