商业化农业应用

基因组学在商业化农业中的应用（例如用于性状筛选的基因分型）已经成为现代农业和育种中不可缺少的一部分。我们的芯片和新一代测序（NGS）技术可以帮助育种人员和研究人员评估和预测植物和动物的遗传优势，为关于动植物选育和健康的关键决策提供指导。

在选择性育种等许多商业化农业应用中，遗传信息筛选在很大程度上取代了物理筛选。与特定的优质性状相关的遗传标记物可用于筛选大量的后代，以识别那些具有理想特征的后代。性状筛选是多基因性状筛选的理想方法。多基因性状难以用传统的育种或繁殖技术来管理，更难从表型上加以鉴定。群体的迭代筛选更容易分离出具有理想性状的后代来用作种畜。Illumina针对基于芯片和测序的解决方案提供了全面的产品组合，能够帮助研究人员筛选出具有期望性状的牲畜和农作物。

在商业化农业应用中，回交的目的是将一种感兴趣的特性（如耐旱性、高产或抗病性）从供体亲代转移到后代。使用Illumina芯片或NGS进行分子标记物辅助回交，让研究人员能够通过易于筛选的遗传连锁标记来监测性状基因的传递。这种方法可显著加快回交程序，并减少推出具有商业价值的植物品系或种畜所需的时间。

遗传标记物可用于鉴定动物，了解后代与亲代的关系。由于单个标记物可能不会产生确定的结果，因此使用多个标记物来增加识别真正亲代的概率。在多代公畜和母畜并存在于畜群中的同种异系繁育情况下，可结合标记结果和饲主对可能的公畜或母畜的了解确定亲缘关系。

转基因生物（GMO）的分子鉴定对于事例判选以及许多国家的监管批准是必要的。NGS的简便性与一致性使这种方法可以出色地替代现有的PCR产物Southern blotting和测序方法。全基因组的深度测序能够确定插入位点的数量、每个位点的拷贝数、插入和原先位点的序列，并分析传代稳定性。