转录组是指由生物的基因组所编码的一整套RNA。宏转录组学包含复杂样品内的一组生物所编码的所有RNA。对于微生物而言,了解基因表达动态对定量转录本水平很关键,因为生物对环境或宿主条件的变化作出反应。微生物转录组和宏转录组信息对于预测特定抗生素的耐药性,了解宿主与病原体的免疫相互作用,以及追踪疾病发展十分重要.
利用新一代测序(NGS)技术,RNA测序(RNA-Seq)已经成为注释和定量完整转录本的标准方法。研究人员提取出细胞RNA并转化成cDNA,并用其制备测序文库。之后他们将序列定位回参考基因组,提供有关特征的定量信息,比如外显子边界和剪接位点,并提供定量的转录本数据,利于多个实验之间的比较。
与芯片等杂交方法不同,RNA-Seq实现了无偏向、链特异的常见和新颖转录本鉴定。宽的动态范围让单个RNA-Seq实验就能自信鉴定高和低的表达子。通过适合自动化的简化流程,多个样品可一次处理。
目前有多种方法来开展这些实验,但我们建议在流程中的每一步使用这些产品。
注意,如果使用TruSeq RNA sample prep kit,您不需要提取RNA并转录成cDNA。如果您使用RNA提取试剂盒,您需要生成dsDNA模板,用于Nextera XT。
单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。
一种从贴壁和悬浮细胞中提取RNA的简单方法。
同时纯化DNA和RNA,用于多个应用,包括基因组文库制备。
Streamlined, cost-efficient, and scalable solution for total RNA analysis.
注意:如果您使用TruSeq RNA sample prep kit,您不需要提取RNA并转录成cDNA。
Speed and simplicity for targeted and small genome sequencing.
MiSeq v3 Reagents Kits简单易用的桌面式测序仪和试剂,产量达15 Gb
NextSeq 500NextSeq桌面式测序系统是第一台也是唯一一台能提供外显子组、转录组和全基因组测序的桌面式测序仪。
Power and efficiency for large-scale genomics.
HiSeq 2500 reagent kits最高通量的测序仪及试剂,产量高达600 Gb
从BaseSpace上下载文件,在BaseSpace上分享文件。
研究微生物转录组图谱的工具和信息,特别是来自高通量技术的转录组数据
Oases为生成转录本而设计的De novo转录组组装程序。
组装转录本,估计其丰度,并在RNA-Seq样品中检测差异表达和调控。