Skip to content

甲基化测序

甲基化测序的优势

胞嘧啶甲基化可显著改变基因的时空表达和染色质重塑。使用新一代测序(NGS),全基因组分析和靶向方法都可以在单核苷酸水平上对甲基化模式进行深入研究。

甲基化测序的优势:

  • 了解人类基因组中CpG、CHH和CHG区域的甲基化模式
  • 利用全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS),几乎可以查看大部分物种基因组中每个胞嘧啶的甲基化
  • 用少量DNA捕获完整的样本多样性
  • 靶向甲基化测序覆盖了经ENCODE、FANTOM5和表观基因组学路线图计划(Epigenomics RoadMap Consortium)确认的人类基因组中感兴趣的区域
使用NGS推进DNA甲基化研究

本电子书介绍了基因组学在基因表达和调控研究中的应用。了解工作流程如何影响研究结果。

立即下载
全基因组甲基化覆盖度

亚硫酸氢盐测序的工作原理是什么?

许多方法利用了NGS的高质量和灵敏度来进行甲基化分析。大多数方法依赖DNA的亚硫酸氢盐转化来检测未甲基化的胞嘧啶。在文库制备过程中,亚硫酸氢盐的转化会将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶。在测序数据中,转化后的碱基会被识别为(PCR后)胸腺嘧啶,并使用read读数来确定甲基化胞嘧啶的百分比。

亚硫酸氢盐转化测序可以用扩增子methyl-seq、靶向富集或全基因组亚硫酸氢盐测序等靶向方法进行。此外,OxBS和TAB-Seq等替代化学技术也可以与NGS一起用于羟甲基化(5-hMc)的鉴定以及甲基化(5-mc)分析。

请参阅DNA甲基化分析领域指南 ,深入了解甲基化分析方法。

Featured Methylation Research

Epigenetic Contributions to Addiction
Epigenetic Contributions to Addiction

Marilee Morgan discusses the use of targeted methylation sequencing to correlate epigenetic signatures with brain image scans of substance abusers.

Read Article

Methylation and Metastasis
Methylation and Metastasis

Researchers use NGS-based methylation sequencing and microarrays to investigate the epigenetics behind cancer metastasis.

Read Article

Runner
Methylation and Exercise

Researchers use RNA-Seq and methylation arrays to study exercise-related epigenetic changes.

Read Article

甲基化测序工作流程

目前世界上90%以上的测序数据是利用Illumina NGS技术产生的。*

Illumina提供了完整的甲基化测序工作流程,从文库制备到数据分析。

相关解决方案

表观遗传学和癌症

癌症表观遗传学变化的研究(如异常甲基化和转录因子结合改变)可以提供对重要致癌通路的了解。深入了解癌症的表观遗传学变化分析

复杂疾病基因组学

全基因组甲基化测序可以帮助研究人员了解神经学、免疫学和其他复杂疾病中起作用的功能机制。深入了解复杂疾病研究

方法指南

得到您需要的信息——包括用于基因组、转录组或表观基因组研究文库制备的BeadChip芯片、测序仪选择、分析及支持——集于一处。通过我们特别为研究应用设计的综合指南为您的实验室选择最好的工具。

查看指南
方法指南

特色文献

The DNA methylation landscape of Chinese hamster ovary (CHO) DP-12 cells.

J Biotechnol 199 38-46 2015

Single-cell DNA methylome sequencing and bioinformatic inference of epigenomic cell-state dynamics.

Cell Rep 10 1386-97 2015

Transient acquisition of pluripotency during somatic cell transdifferentiation with iPSC reprogramming factors.

Nat Biotechnol 33 769-74 2015

希望收到有关基因组学分析技术的快讯、案例研究和信息?

请输入您的电子邮箱地址。

Additional Resources

Peter Laird:表观遗传学、DNA甲基化和芯片
Peter Laird:表观遗传学、DNA甲基化和芯片

Peter Laird博士介绍了他的表观遗传学研究,以及DNA甲基化在促进癌症方面的作用。

Whole-Genome Bisulfite Sequencing Library Prep
Whole-Genome Bisulfite Sequencing Library Prep

Efficient nanogram-scale library preparation, sequencing, and analysis of DNA methylation.

Library Prep for WGBS with Fraz Syed
Library Prep for WGBS with Fraz Syed

Illumina scientist Fraz Syed explains library preparation for whole-genome bisulfite sequencing.

*根据Illumina公司2015年存档数据计算