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Assays, 微生物基因组学, Cellular & Molecular Biology

巴西小镇全民接种疫苗

布坦坦研究所如何帮助塞拉纳小镇全民接种疫苗——他们从中学到了什么?

巴西小镇全民接种疫苗
2021年7月15日

今年春末,巴西东南部小镇塞拉纳(Serrana)开始恢复正常生活。隔离一年后,朋友和邻居重新开始聚会。美发沙龙和餐馆接待的顾客也逐渐增多。

塞拉纳能逐渐恢复正常生活要归功于布坦坦研究所(Butantan Institute)开展的一项工作,布坦坦研究所是一家位于圣保罗的研究中心,为巴西公共卫生系统提供药物和疫苗。现在,塞拉纳95%以上的成年人已接种新冠疫苗。从许多方面来看,塞拉纳都是巴西疫情中的一个亮点,尽管对巴西来说这是一种反常现象,因为国内其他地区的病例仍在持续增加,只有大约四分之一 的巴西人口接种了疫苗。

自2020年3月以来,该研究所采取了多种措施以应对COVID-19。起初,他们主要诊断是否感染病毒,并与圣保罗州合作,处理他们积压的样本。据科学发展中心副主任Maria Carolina Quartim Barbarosa Elias Sabbaga称,布坦坦研究所每天检测约20,000份样本。

2021年初,布坦坦研究所的研究人员启动了雄心勃勃的“Project S”(S计划),即为塞拉纳的成年人接种疫苗。2020年7月,该研究所获准测试CoronaVac疫苗,该疫苗最初由中国香港的一家生物技术公司Sinovac开发。此后,布坦坦研究所获得了技术转让,在巴西生产和分销CoronaVac疫苗。尽管CoronaVac在预防COVID-19重症方面有效性只有50%左右,但在塞拉纳进行大规模疫苗接种后,当地的新冠死亡人数减少了近95%。

鉴于在巴西和塞拉纳流行的新冠病毒主要为P.1变体,这一结果十分令人惊喜。

布坦坦研究所的科学家们同时也在利用测序来追踪病毒的传播——他们借助了Illumina的基因组技术。

“如果我们想要充分认识这场大流行,就必须对其进行测序。通过测序,你可以了解病毒基因组以及某一阶段在某个地区、州和国家传播的变体类型。如果不进行测序,我们就不知道发生了什么,”Sabbaga说。

完成疫苗接种后,布坦坦研究所的研究人员将目标转向了监测塞拉纳的突破性病例。Sabbaga表示,科学家们还希望通过监测了解圣保罗州存在哪些变体,甚至可能将监测范围扩大至整个巴西,以帮助监测全国范围内的COVID-19。

布坦坦研究所专门创建了一个网络用于收集不同城市的样本,以追踪新变体的传播。今年三月,布坦坦研究所及其合作伙伴引进了Illumina的技术,包括NextSeq 2000MiSeq。他们同时也在使用Illumina的COVIDSeq检测追踪病毒变体。

“我们决定使用Illumina的仪器,因为它是这一领域的金标准,”Sabbaga表示。到目前为止,她和团队成员均对Illumina系统的准确性感到非常满意。

Sabbaga和研究所的同事还在继续对塞拉纳接种疫苗后的个体样本进行测序,到目前为止,尚未发现在接种后出现新变异的情况。她很感激这些工具能帮助他们更好地了解病毒,并且认识到这些工具不仅可以用于追踪COVID,还可以在未来追踪其他传染性疾病。

如需了解用于NovaSeq 6000和NextSeq系列系统的COVIDSeq的更多信息,请点击此处

有关用于MiSeq、MiniSeq和iSeq 100系统的全新96样本检测的信息,请点击此处

如需了解有关鉴定和追踪传染性疾病威胁的信息,请点击此处

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