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NovaSeq的应用和方法

应用广泛,一个平台涵盖全部

对于任何测序方法、基因组和规模的项目都灵活简便

主要应用和方法

NovaSeq可更经济高效地开展全基因组测序。使用简单的一体化、自动化工作流程,在双流动槽模式可下生成高达6 Tb和200亿条read的可扩展产出。该系统可在1天内对一组3个样本进行测序,也可在2天左右的时间里对多达48个基因组进行测序,以实现更全面的覆盖。

文库制备
three to five hours
Illumina DNA PCR-Free Prep

高性能、快速、集成的工作流程,适用于人类全基因组测序或肿瘤-正常测序等灵敏应用。

llumina DNA Prep

快速、集成的工作流程,适合广泛的应用,从人类全基因组测序到扩增子、质粒和各种微生物。

测序
less than or equal to 44 hours
NovaSeq Reagent Kits v1.5

新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。

分析
less than 25 minutes

*每个样本的分析时间,假设200x覆盖度/样本

DRAGEN Germline Pipeline(BSSH或DRAGEN服务器上)

DRAGEN Germline Pipeline v3可进行比对和选择性变异检出,可输入FASTQ文件,输出BAM和VCF文件(可同时输出两种格式的文件)。

DRAGEN Somatic Pipeline(BSSH或DRAGEN服务器上)

DRAGEN Somatic Pipeline可进行比对和变异检出,可输入仅肿瘤或肿瘤/正常FASTQ文件,输出BAM和VCF文件。

WES只检测不到2%的基因组,是一种比WGS更经济实惠的选择。NovaSeq系统使用双S4流动槽,单次运行可提供多达500个外显子组的测序。

文库制备
six hours

*总制备时间2.5天,手动操作时间6小时

Illumina DNA Prep with Enrichment

此试剂盒采用了快速且用户友好的工作流程。On-Bead Tagmentation测序化学技术结合了简化的单一杂交实验方案,缩短了整个工作流程所用的时间。

测序
about twenty-five hours
NovaSeq Reagent Kits v1.5

新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。

分析
less than eight minutes

*每个样本的分析时间,假设100x覆盖度/样本

DRAGEN Enrichment

此应用程序可进行比对和选择性变异检出,可输入FASTQ,BAM或CRAM文件,输出BAM和VCF文件(可同时输出两种格式的文件)。

在普通或低质量样本中发现编码RNA和多种形式的非编码RNA。借助NovaSeq系统,您可以使用双S4流动槽在单次运行中对多达400个转录组进行测序。

文库制备
about seven hours
Illumina Stranded Total RNA Prep

使用多种样本快速制备文库,以极大的灵活性研究编码和非编码转录组。

测序
about twenty-five hours
NovaSeq Reagent Kits v1.5

新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。

分析
less than fifteen minutes

*每个样本的分析时间,假设200x覆盖度/样本

DRAGEN RNA Pipeline

进行比对、定量和融合检测。

NovaSeq 6000系统工作流程简介

与高级实验室经理Brian Steffy以及测序系统经理David Miller一起,了解NovaSeq系统的一体化工作流程。直接了解为什么该系统是本公司最先进的高通量测序仪。

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特色NovaSeq案例

全新液体活检与大样本量检测分析加入TruSight Oncology产品系列

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进行微生物组研究的理想时机

利用NovaSeq 6000系统研究宿主-微生物关系,为研究人员和制药公司提供相关数据,改善药物发现。

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揭示肿瘤细胞内通讯

科学家利用NovaSeq 6000系统研究肿瘤细胞周围的微环境。了解这种微环境可以告诉我们很多关于肿瘤细胞如何迁移以及耐药性产生的信息。

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更多应用和方法

目标富集

利用序列特异性杂交技术分析感兴趣的基因组区域。

编码转录组分析

使用RNA编码区域的序列特异性捕获发现已知和未知的编码转录组功能。

靶向DNA测序

靶向重测序专注于对基因子集或感兴趣研究区域的基因组的分析,节省时间与花费。

甲基化测序

基于测序的DNA甲基化分析可以提高覆盖密度与灵活性,从而增进表观遗传学研究的能力。

使用mRNA-Seq进行基因表达谱分析

mRNA测序(mRNA-Seq)发现已知和未知转录的同时度量转录的丰度,从而能够绘制准确而全面的表达图谱。

从头测序

从头测序是指在没有任何参考序列的情况下对某个未知基因组进行测序。NGS可以对任何物种进行快速而准确的特征分析。

使用染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)进行DNA-蛋白质互作分析

将染色质免疫沉淀(ChIP)方法与测序结合在一起,ChIP-Seq是基因调控全基因组研究的强大方法。

群体研究

用于群体测序中聚合并解释大规模基因数据的可靠、安全、可扩展的平台。

宏基因组学

在复杂样本中全面展现生物体样本基因,来评估细菌多样性、发现无法培养的微生物。

单细胞RNA测序

通过分析转录组来研究复杂组织中各个单细胞的作用。

ctDNA测序

NGS为癌症研究人员提供了检测血液中低水平ctDNA所需的高灵敏度和特异性。

RNA药物反应生物标记的发现

了解如何利用RNA-Seq发现并分析基于RNA的药物反应生物标记。查看帮助新用户开展此应用的资源。

Illumina方法指南

得到您需要的信息——包括用于基因组、转录组或表观基因组研究文库制备的BeadChip芯片、测序仪选择、分析及支持——集于一处。通过我们特别为研究应用设计的综合指南为您的实验室选择最合适的工具。

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